JingHua's profile裴伴我PhotosBlogListsMore Tools Help

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    发愣在--研究室

         好久没这么清闲
         丢开萱萱自由的写东东
         老板去了美国
         研究室里也只有几个研究员
         其他的人都无故休假
         呵呵
         我也就上来闲扯几句
     
         中午忙完,不到11点就跑回了家
         本想睡一觉
         计划怎么能有变化快 
         抱着萱萱,对着老妈强调“这是我的女儿“
         妈妈一句“真的这么好嘛?!”
         然后就感叹到现在也不敢相信我已经为人母了
         就这样时间悄悄地溜走了
         我又昏昏沉沉地坐在这里
     
         其实养萱萱的大部分日子我都在感受我的母亲都在反思
         萱萱让我更理解我的母亲
         在理解的同时学着爱她疼她更要学会照顾她
         她是如何的含辛茹苦的把我和妹妹拉扯大
         是用怎样的心情把56天的我送到幼儿园
         是怎样面对每次在幼儿园抢不到自己喜欢的玩具时晕倒的我
         是如何前面抱一个后面背一个
         是如何教育这个不会认错的我
         是怎么割舍她最亲爱的女儿来了这个陌生的国度
         是用怎样的精神克服一切困难
         面对我和妹妹的时候也还是微笑
         每次在电话里都能感受到她的坚强她的乐观她所散发出的“劲“
         呵呵,可是她到底是如何面对 一个哭到8岁的我呢?!
     
         嗯,和妈妈一起带萱萱的日子很幸福
         妈妈也很开心
         或许她也时常会想到儿时的我
         回忆她第一次当妈妈的感受
         想到很多我曾经给她带来的幸福感受
         这个让她第一次当妈妈的我也当妈妈了...
         嗯,也许萱萱为人母的时候我才能真切感受到现在的我的妈妈...
     
         엄마 너무너무 사랑해!!!
         엄마가 옆에 있어서 항상 행복하고 든든해요
     
        

    ......

    NCBI生物信息学研究工具http://www.ncbi.nih.gov/Tools/
    NCBI生物信息学研究工具网站由美国国家生物技术信息中心支持。该网站提供了许多程序的链接,内容包括数据挖掘、核酸和蛋白质组分析等。同时,网站还提供了许多相关链接和资源。
    
    欧洲生物信息学研究所http://www.ebi.ac.uk/
    欧洲生物信息学研究所是一个非盈利学术机构,是欧洲分子生物学实验室的一部分。它是生物信息学研究和服务的中心。它所管理生物数据的数据库包括核酸,蛋白质序列和大分子结构。它的使命是保证从分子生物学和基因组研究的日益增长的信息向公众公开,并且对科学研究团体提供任何方面的免费使用,以促进科学发展。
    欧洲生物信息学研究所Ensembl基因组浏览器:ttp://www.ebi.ac.uk/ensembl/index.html
    欧洲生物信息学研究所Thornton研究组http://www.ebi.ac.uk/Thornton/index.html
    欧洲生物信息学研究所多序列联配数据库:
    http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/alignment.html
    欧洲生物信息学研究所工具箱http://www.ebi.ac.uk/Tools/
    欧洲生物信息学研究所核酸数据库http://www.ebi.ac.uk/Databases/nucleotide.html
    欧洲生物信息学研究所计算基因组研究组http://www.ebi.ac.uk/research/CGG/index.html
    欧洲生物信息学研究所完整基因组数据库http://www.ebi.ac.uk/genomes/
    欧洲生物信息学研究所序列数据库研究组http://www.ebi.ac.uk/seqdb/index.html
    
    Brutlag生物信息学研究组http://motif.stanford.edu/
    Brutlag生物信息学研究组是斯坦福大学的一个研究团体,主要研究从蛋白质一级结构预测蛋白质结构和功能,其开发了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF软件应用于非鉴定的基因组序列的功能确定,另外还开发了LOCK和3DSEARCH软件用于比较蛋白质结构和蛋白质结构数据库的搜索。
    
    生物GBF信息学小组主页http://transfac.gbf.de/
    生物信息学小组主页是德国生物技术研究中心的生物信息组的主页。其提供的资源十分丰富,包括出版物、研究计划、研究组介绍、五个重要数据库、十二个工具软件和资源链接等。
    
    Pune大学生物信息学中心http://bioinfo.ernet.in/
    Pune大学生物信息学中心成立于1987年,是生物技术系统的九大中心之一。提供生物工程领域的信息,侧重病毒学,蛋白质和核酸序列与结构。其提供的资源丰富,包括数据库、微生物菌株数据网络系统、生物信息学中心图书馆、Alpha服务器的软件包、生物信息学的有用网址、EBI和PDB的数据库镜像等。
    
    北京大学生物信息学中心http://www.cbi.pku.edu.cn/
    北京大学生物信息中心(CBI)成立于1997年,是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家接点。几年来,已经与多个国家的生物信息中心建立了合作关系。目前是国内数据库种类最多,数据量最大的生物信息站点。在基因预测、基因组、蛋白质结构等领域都有相应的研究项目。
    
    加拿大生物信息学资源http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/index_e.php
    这是加拿大生物信息学资源(CBR)的网站。该网站由加拿大国家研究委员会(NRC)创建,旨在为国家研究委员会与其它**、学术部门的科学家提供广泛使用的生物信息学工具和共享数据。加拿大生物信息学资源部分由一个专门使用该资源的委员会管理,而且其资源在用于教育和非盈利研究时只需注册均可免费作用。网站还提供有关新闻、服务与下载等信息。
    结构生物信息学公司http://www.strubix.com/
    结构生物信息学公司是世界上占领导地位的、蛋白质组学推动的药物发现的公司,他们大规模地产生和使用蛋白质结构信息,以期加速发现和优化过程。它提供的软件主要针对加速药物发现和优化过程、提高筛选效率和降低成本、极大地重视知识产权的地位、提高药物性能和增加技术和市场成功的可能性。此外,还提供三个药物数据库。
    
    林奈斯生物信息学中心http://www.lcb.uu.se/
    这是林奈斯生物信息学中心(LCB)的网站。林奈斯生物信息学中心研究非常活跃,隶属于瑞典Uppsala生物医学中心。作为一个由Uppsala大学与瑞典农业大学的联合研究机构,确保了高质量的尖端的研究与教育,其研究范围从微生物与哺乳动物基因组学经计算机的功能基因组学到分子进化。网站还提供有关入学、新闻时事、研讨会、工具、学生计划等方面的信息。
    曼彻斯特大学生物信息学教育与研究http://www.bioinf.man.ac.uk/
    曼彻斯特大学生物信息学教育与研究是欧洲分子生物网络的节点之一,负责维护一些数据库(如蛋白质模体指纹数据库,PRINTS)。站点提供蛋白质同源性分析,蛋白质模体指纹分析,系统发生和序列进化分析,以及微阵列分析,并提供生物信息学和PRINTS数据库数据下载。
    
    《生物信息学》http://www3.oup.co.uk/jnls/list/bioinformatics/etoc.html
    生物信息学》是由英国牛津大学出版社出版。其主要刊登生物信息和计算生物学方面的研究论文、书评、综述、读者来信和述评等文章。其刊载的文章在两年内供给学术界免费使用。
    生物信息学http://biotech.icmb.utexas.edu/pages/bioinfo.html
    生物信息学是印第安纳大学分子和细胞生物学研究所提供的生物信息学资源。此资源包括数据库、基因发现程序、蛋白质模建、生物信息学在线教程、研究基金的来源、研究项目和生物信息学工具软件等。
    
    生物信息学的网络资源http://www1.cs.columbia.edu/~cleslie/cs4761/resources.html
    生物信息学的网络资源是美国哥伦比亚大学的Bill Noble教授建立的有关生物信息学的网络资源总集。其涉及面广,包括基因组学和生物信息学中心、生物信息学工具和基因组计划索引、DNA和蛋白质分析工具、生物信息学课程主页、生物信息学和生物技术的学术项目、生物信息学文献参考,以及网上引物。
    
    生物信息学趋势导向http://www.ped.med.utah.edu/genpedscrr/Trends.htm
    生物信息学趋势导向主要提供《今天免疫学》杂志的增刊有关生物信息学的内容。这些内容包括的资源十分丰富,涉及文本格式数据库,原理和实用数据库搜索,计算生物学基因发现,多序列联配和检索,蛋白质分类和功能归属,系统进化分析和比较基因组学,功能基因组学等。
    
    生物信息学网http://starr2.myetang.com/
    这是生物信息学的网站,主要是负责中国医学科学院肿瘤医院/肿瘤研究所生物信息学研发及服务工作。该网站提供生物统计分析以SAS和R为主,并且设有其他数十种生物信息学分析辅助软件,如Blast, Phrap, Bioperl, EMBOSS, Hmmer, GO等等。另外也提供论坛,相关论文以及常用生物信息学网址等。
    
    生物信息学小组http://life.anu.edu.au/
    生物信息学小组成立于1997年,主要从事分子生物信息学和生物多样性信息学的研究。其提供丰富的软件资源,可免费下载使用。软件种类涉及重组扫描、系统发生分析、联配、重复片段的检测和PCR引物设计等。此外,还有许多数据库资源。生物信息学入门教材
    
    国内主要教材有:
    《生物信息学概论》(英) T K Attwood , D J Parry-Smith 著  罗静初 等译
                北京大学出版社 2002年4月第一版
      本书从生物信息学的研究对象、意义出发,介绍生物信息学研究的基本方法和常用工具。主要介绍的是核酸和蛋白质序列的计算机分析方法,探讨利用现有的计算机程序,从现有的数据库中能够获取什么、不能够获取什么。全书共分十章:1.概论,2.信息网络,3.蛋白质信息资源,4.基因组信息资源,5. DNA序列分析,6.双序列比对,7.多序列比对,8.二次数据库搜索,9.数据库搜索实例,10.序列分析软件包。每章末尾均提供了进一步阅读指南和有关的网址。这本书的一大特色在于丰富的例子和图表,使读者可以很直观的了解和掌握书中的内容。此外,书的末尾还附有与生物信息学相关的词汇表。总的说来,这本书实用性强,可以作为高等院校生物信息学教材,也可以作为生命科学和生物技术各领域分子生物学研究和开发工作者的生物信息学参考书。
    
    《生物信息学手册》       郝柏林 张淑誉 编著
                  上海科学技术出版社 2000年10月第一版
      一本手册式的生物信息学书籍。除了介绍了生物信息学,还包括了计算机及计算机网络(这一部分提供了一些网址)和分子生物学的知识。更为重要的是,该书的主要部分?quot;生物信息数据库"和"服务、软件和算法"部分,提供了大量的网址。 几乎是每一个条目下面都有不少网址。这本书将网络上的生物信息学资源进行了索引式的介绍,并作了必要的说明。书中列举了近千条网址和引文,基本涵盖了生物学研究的各个方面,堪称生物信息的汪洋大海中的导航图。对生物信息学的服务、软件和算法,本书也作了较全面的描述。本书可供广大生命科学工作者以及由物理学、数学和计算机学转入生命科学领域的研究教学人员参阅(上面可以查到很多网址)。
    《生物信息学》        赵国屏 等 编著
                 科学出版社 2002年4月 第一版
      本书是"863"生物高科技丛书之一。它比较全面地介绍了生物信息学的若干个主要分支,并特别介绍了与人类基因组研究相关的生物信息学的一些较新成果;着重介绍了数据库和数据库的查询、序列的同源比较及其在生物进化研究中的应用;以生物芯片中的生物信息学问题为例,介绍与基因表达相关的生物信息学问题;还介绍了蛋白质结构研究中的生物信息学问题,以及与分子设计和药物设计相关的生物信息学技术。本书可供生物信息学专业和生命科学相关专业的本科生、研究生和教学科研人员阅读学习,也可供相关专业的科技和应用机构的科研、管理和决策人员参考。注意,本书有很大篇幅是讲基因芯片和蛋白质结构预测的。
    
    《生物信息学--基因和蛋白质分析的实用指南》
    "Bioinformatics--A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins "这本书由前卫计算生物学家撰写,贯穿了已有的工具和数据库,包括应用软件、因特网资源、向数据库提交DNA序列以及进行序列分析和利用核酸序列与蛋白质序列进行预测的的方法。以下是该书的目录:1.因特网与生物学家,2. GeneBank序列数据库,3.结构数据库,4.应用GCG进行序列分析,5.生物数据库的信息检索,6. NCBI数据模型,7.序列比对和数据库搜索,8.多序列比对和实际应用,9.系统发育分析,10.利用核酸序列的预测方法,11.利用蛋白质序列的预测方法,12.鼠类和人类公用物理图谱数据库漫游,13. ACEDB: 基因组信息数据库,14.提交DNA序列数据库。本书有很多实际的序列和序列分析的例子。这本书适合高等院校的师生和从事生物工程研究的科技工作者阅读。
    
    此外,浙江大学樊龙江老师《生物信息学札记》手稿也是入门的很好教材 ,书目录如下:
    第一章 生物信息学通论
    第二章 分子数据库
    第三章 序列分析与比较
    序列组成与联配分析
    数据库搜索引擎——BLAST和FASTA应用
    第四章 基因组测序与分析
    第五章 分子进化
    第六章 蛋白质结构与功能预测
    附录:生物信息学主要英文术语及释义
    核苷酸和氨基酸代码
    分子生物学主要数据库和应用工具网址一览表
    序列分析软件目录
    与核苷酸和蛋白质序列相关的特征关键词表
    主要参考文献
    
    国外有关生物信息学书籍有:华盛顿大学bioinformatics教程、Algorithms in Bioinformatics、Beginning Perl for Bioinformatics、Bioinformatics、Bioinformatics-Sequence and Genome Analysis、Developing Bioinformatics Computer Skills、
    BIOINFORMATICS METHODS AND PROTOCOLS等书籍。

    关注...

          上岗已经整7天了,都是在家和研究室间转悠,没有太多空余的时间整理这里。今天韩国竞选国会议员,我也有幸休息一天...
          妈妈送我的相机,在我和老公出去浪漫的时候丢了,却在一周过后才发现,把家里翻了个地儿朝天,也没找到,唉!挣钱再买一个吧。每天都期待着能快点回家,能快点抱到我的宝贝。老公已经开始进入状态了,度过他余下的学生时代,但是充当爸爸的角色也并非是简单的事情。上周三,研究室开完会,收到老公的短信,说因为论文着急写,晚上不回家吃饭了,他这个男人总是懒得吃饭,饿一顿饱一顿的,想着这么拼命的老公,我决定买点东西给他送去,给他一点意外,省的总说我不关心他...这个时候超市的紫菜饱饭已经快过期了,面包填饱肚子又有点牵强,只好绕道去那家他喜欢的盒饭店。嗯,叫了他最喜欢的도련님도시락,等待中,不经意间转头看到旁边刚刚推门进来的人,一个很熟悉的面孔,不由自主地拍了拍这个人,在我拍他的瞬间我还在怀疑我的眼睛,我是不是拍错了呢?!嗬嗬,是老公。因为这家盒饭店离他的学校还是有点距离的。他更是吓得目瞪口呆,但是我知道他被我小小的行动感动了,他以为我的世界里只有女儿没有他的位子了,其实他才是我们这个家的顶梁柱,我怎么可能让他饿着肚子呢。我们开心的拿着盒饭,俩个人又去吃了汉堡。之后他目送我上了巴士...一路上我就在想,我们真的是夫妻,世界这么大,中国这么大,首尔也不小,我们的学校还3个校区,我们还是没有约定的这么活生生的面对面,让我突然想到林忆莲的<与爱长流〉--倘若没有遇见你,我们会怎么走,一左,一右,绕地球一圈,一定会碰头。
          上次带着萱萱去打预防针,在通往小儿科的电梯上一个小男孩,我判定他应该刚刚会说话,总是偷看老公怀里的萱萱,还试图摸萱萱的小脸蛋。萱萱爸还高兴的傻乐,等轮到萱萱打针的时候了,刚扎进去,萱萱就大声地哭了起来,那个电梯里碰到的小男孩就冲进了诊疗室,冲着大夫就喊:为什么哭了?!那表情分明是打抱不平,很生气的样子,幸好他的妈妈也跟着跑了进来,把他拉了出去。回来的路上,萱萱爸就说那个男孩子真不错,说长得也不错,哎呀,这个老公现在就着急给自己找女婿了。愁人!但是总会不经意地想到那个男孩子的那幅表情,想到的时候就会不自觉地乐出声来。嗯,真的希望萱萱能碰到爱她,疼她的男人。嘻嘻...女人天生就是为了让人疼得,真是没错。小的时候父母疼,长大了还有老公疼。
         
           我们流浪有多久  陌生世界里
           期盼熟悉的温柔
           生活在同一个星球
           一直的漫游  只为着和你牵手
           我的以后  在你心头
           整个宇宙  感动得颤抖
           我的眼泪  由你来流
           玫瑰拥抱沙丘  熬过多少关口
           啊  与爱长流
           我们已相爱有多久
           遇见你以前  错过了几个街头
           我已经等待你多久
           差一点不敢  对爱情再有要求
           倘若没有遇见你
           我们会怎么走
           一左
           一右
           绕地球一圈
           一定会碰头

    归位

    昨夜互换了家书后
    我们似乎比任何时候都期待未来了
    嗯,终于回来了
    坐在属于我的空间里
    开始原本属于我的日子
    萱萱在干什么呢?!
     
    昨天还有一点点害怕这里的人和事
    还好,没有什么太大的变化
    我的位子由一楼实验室搬到了六楼的DNA BANK
    一切都是崭新的
    旁边还有个小秘书...嘻嘻